סוגי אפיזומה ומאפייניהם

א episome, בתחום הגנטיקה, היא מולקולת DNA כי הוא מסוגל לשכפל עצמאי בציטופלסמה של התא המארח, ומשולב פיזית לתוך כרומוזום זה משוכפל גם מולקולה בודדת (שאנו מכנים שאני cointegrate ).

את אפוי, אם כן, ניתן לפרש כדרך של דו קיום, ולא כסוג של replicon. למעשה, עבור מחברים מסוימים, טרנספוזונים ורצפי ההכנסה יכולים להיחשב כאפיזודות, שכן הם אכן מתבצעים על הכרומוזום של התא המארח, אף על פי שלעולם אין להם קיום עצמאי אוטונומי בציטופלסמה..

בתאים אאוקריוטיים, לעומת זאת, אפיזום מתייחס יותר לשכפול נגיפי המתקיים כפלסמידים בתאים נגועים מאשר לווירוסים שניתן לשלבם בגנום של התא המארח.

זה לא המקרה היחיד שבו אותה מילה פירושה דברים שונים eukaryotes ו prokaryotes (למשל, המונח טרנספורמציה). לתופעות יש היסטוריה עשירה בפיתוח של גנטיקה מודרנית, שכן הם עזרו לפענח תופעות מעניינות הקשורות בירושה.

אינדקס

• 1 episomes כי הם bacteriophages
• 2 episomes כי הם פלסמידים
• 3 פרקים בתאים האיקריוטים
• 4 מסקנות
• 5 הפניות

Episomes כי הם bacteriophages

אחת הדוגמאות הקלאסיות של episomes היא lambda bacteriophage בחיידק המארח שלה, הידועה ביותר הוא Escherichia coli. A bacteriophage (מקוצר phage) הוא וירוס מדביק חיידקים.

בתנאים המאפשרים זיהום של החיידק על ידי phage, הגנום ויראלי הציג לתוך הציטופלסמה כמו מולקולה ליניארית יכול להיות מעגלי, ועל ידי אירועים ספציפיים באתר רקומבינציה, משולב כרומוזום של החיידק המארח.

בתוך הגנום הפאג יש רצף קצר של נוקליאוטידים (attλ) המשלים באופן מושלם לאתר מחייב (התקשרות) בכרומוזום העגול של החיידק (ATB).

אירוע הרקומבינציה בין שני האתרים מוביל ליצירת קואינטגרציה בין שני עיגולים המביאים למעגל גדול יותר. כאשר הכרומוזום של החיידק משוכפל, אם כן, הגנום של הנגיף משוכפל (במצב של אפיזודה).

זה יכול לקרות במשך דורות אינסופיים אלא אירוע אינדוקטיביים המוביל הכריתה של הגנום הויראלי, וכניסה עוקבת לתוך המחזור בשכפול הדנ"א האוטונומי של הנגיף לשיאו עם תמס של החיידקים כדי לשחרר את ויריונים החדשים שנוצרו.

Episomes כי הם פלסמידים

עוד דוגמאות ידועות ביותר של episomes היא גורמות פוריות או פלסמיד פ לפעמים, תלוי החוקה נוקלאוטיד של החיידקים המארחים (למשל, E. coli), הפלסמיד המעגלית משלבת מחדש עם אתרים הומולוגיים נוכחיים על כרומוזום של חיידקים שמקורם cointegrate.

כלומר, פלסמיד יכול לשכפל במספר עותק נמוך בציטופלסמה של החיידק, או אם משולבים, לשכפל בכללותו במספר עותקים המתאימים לזה של החיידק ללא F (בדרך כלל אחד).

במעמדה כמו episome, F נותן את החיידקים היכולת לייצר מספר רב של רקומביננטים לאחר תהליך הצמידה.

חיידק F + (כלומר, בעל פלסמיד F אוטונומית) חווה החדרת אלמנט זה אמור להיות HFR (רקומבינציה בתדירות גבוהה עבור אנגלית קצר), כמו עבור נטיה האירוע, היא תיאורטית מסוגל "לגרור" את כרומוזום חיידקי כולו בכל חיידקים F- (כלומר, חסר הגורם או פלסמיד פוריות F).

באופן כללי, רצפים המספקים הומולוגיה (ומכאן דמיון ואת השלמה) בין פלסמיד F לבין כרומוזום החיידקים לתהליך רקומבינציה הספציפי באתר המוליד אימות cointegrated הם רצפי החדרה.

Episomes בתאי eukaryotic

מסיבות היסטוריות, המונח episome (מעל + גוף) היה תמיד קשור לזה של פלסמיד, אשר במקור נובע מהעולם של אלמנטים extrachromosomal prokaryotes.

כאשר מציאת אלמנטים דומים ב- eukaryotes, נעשה שימוש כדי לקבוע מולקולות של גנום הנגיף מסוגל לשכפל את עצמו בסוג זה של תאים נגועים עם תכונות הדומות לאלה של פלסמידים prokaryotes..

כלומר, בתאים אאוקריוטיים נגועים בווירוסים אנו מוצאים שבמקרים מסוימים, כחלק ממעגל השכפול שלהם, הווירוס מתפתח בתא כמו מולקולת דנ"א עגולה הדומה לשכפלות אחרות המתוארות, למשל, בחיידקים.

הווירוסים הנפוצים ביותר שיכולים להתקיים כמולקולות דנ"א עגולות של שכפול אוטונומי (מהכרומוזום המארח) שייכות למשפחות הרפסוורידיא, אדנובירידה ופוליומבירידיא.

אף אחד מהם, לעומת זאת, אינו משולב בגנום המארח - ולכן הם יכולים להיחשב לשכפל כמו פלסמידים ואינם עומדים באיכות המהותית המאפיינת אפיזודה: להשתלב בגנום של המארח.

אף על פי שהחיסול של המונח הוצע, זה עשוי רק להוסיף בלבול לנושא שכבר מורכב למדי בפני עצמו..

מסקנות

בקיצור, ניתן לומר כי אפיזודה, באופן אטימולוגי, היא אלמנט גנטי של שכפול אוטונומי שיכול להתקיים בתא כמו מולקולת דנ"א חופשית, או משולבת פיזית עם המארח.

אולם מנקודת המבט של הגנטיקה, אפיזומה היא פלסמיד או וירוס שניתן לשלב בגנום הפרוקריוטים, או להיות אחד מסוגי הפלסמידים שתא אוקריוטי יכול לנחות.

מעניין, וירוסים שניתן להכניס לגנום של המארח האיקריוטי (רטרווירוס) אינם נחשבים לאפיזודות.

הפניות

1. Brock, T. D 1990. הופעתה של גנטיקה בקטריאלית. הקרה ספרינג הארבור מעבדה הקש. קולד ספרינג הארבור, MA, ארצות הברית.
2. Griffiths, A.J.F., Wessler, S.R., Carroll, S.B. & Do Dobley, J. to Genetic Analysis. וו פרימן & Co, מקמילן שותפים. לונדון, בריטניה.
3. ג 'נטיקה של חיידקים ווירוסים שלהם, מהדורה שנייה. פרסומים מדעיים.
4. יעקב, פ & וולמן, א 'ל 1958. Les épisomes, אלמנטים génétiques ajoutés. קומפטס רנדוס דה ל'אקדמי למדעים בפריז, 247 (1): 154-156.
5. לוי, י ', פראנקל-קונראט, ה' ואוונס, א. ש. 1994. וירולוגיה, מהדורה שלישית. פרנטיס הול. אנגלווד קליפים, ניו ג 'רזי, ארצות הברית.